باكتري E.coli o157:H7 يكي از پاتوژن هاي مهم در سيستم گوارش در انسان مي باشد. دام و احشام مهمترين منبع اين باكتري بوده و ضمن ابتلا به اين ميكروب مي تواننند آن را به انسان منتقل كنند جهت كاهش شيوع اين باكتري در دام و متعاقبا در انسان انجام واكسيناسيون و كنترل اين باكتري در دامها يك راهكار بسيار مناسب مي باشد. آنتروهموراژيك E.coli جهت اتصال به سلول ميزبان عوامل پروتئيني خاصي دارد كه از طريق آن بر روي سلول ميزبان كلونيزه مي شود. اين عوامل در ميانكنش با سلول ميزبان يك ساختار بخصوص ايجاد مي كند كه از نظر هيستوپاتولوژي اتصال و تخريب ناميده مي شود. پروتئين هاي Tir,Intimin و EspA توسط ژنهاي مستقر رد لوكوس كمپلكس attaching/effacing ساخته مي شود. پروتئين هاي EspA بخشي از سيستم ترشحي نوع 3 Type Three Seretion System مي باشد كه ساختار سوزني يا رشته اي را ساخته و مولكول Tir را به سلول هاي پوششي ميزبان انتقال مي دهد. در حاليكه پروتئين Intimin به عنوان لنگرگاهي در داخل غشا باكتري مستقر شده و ضمن ميانكنش و تركيب با Tir در نهايت موجب اتصال باكتري مي شود نتيجه عملكرد اين اجزاء چند گانه پديده اتصال باكتري مهاجم و در نهايت تخريب ديواره سلول ميزبان مي باشد. در روش ارايه شده يك كاست ژني مصنوعي طراحي شده است كه شامل سه بخش آنتي ژني از مولكول هاي فوق مي باشد. 282 اسيد آمينه از انتهاي كربوكسيل Intimin به همراه بخشي از قطعه Tir حاوي اسيد آمينه هاي ناحيه 258 - 361 و در نهايت 120 اسيد آمينه انتهاي كربوكسيل EspA مي باشد. اين رشته DNA مصنوعي توسط لينكر هايژ از جنس اسيد نوكلئيك خاص به يكديگر متصل مي شوند. براي اطمينان از عملكرد اين ژن مصنوعي و محصول پروتئيني آن از طريق نرم افزارهاي موجود ساختار mRNA و سپس پروتئين آن بررسي گرديد. پس از اطمينان از حفظ ساختار و عملكرد آنتي ژنيك پروتئين كايمريك به صورت نوتركيب در ميزبان Ecoli و همچنين بذر گياه كلزاي تراريخت توليد گرديد. جهت بررسي ايمني زايي از مدل حيواني موش و براي مقايسه از دو روش تزريق زير پوستي (با استفاده از پروتئين نوتركيب خالص شده از E.coli و خوراكي (با استفاده از بافت بذر گياه تراريخت) استفاده گرديد. ارزيابي آنتي بادي بر عليه سه پروتئين Tir,Intimin و EspA در هر دو گروه موشها تيتر بالايي از ايمونوگلوبوليتهاي اختصاصي بر عليه اين آنتي ژنها را در سرم موشهاي ايمن شده نشان داد. همچنين نتايج چالش با باكتري بيماريزا نشان داد كه موشهاي ايمن شده (هر دو گروه) در مقابل باكتري Ecoli O157:H7 مقاومت كرده و ضمن حفظ سلامت خود باكتري به سرعت از روده آنها پاك مي شود. در همين شرايط حيوانات گروه كنترل (مايمن نشده) علايم بيماري و پايداري باكتري درون روده خود را نشان مي دهند. نتايج نشان مي دهد كه طراحي يك آنتي ژن مصنوعي سه قسمتي كه حاوي نواحي خاصي از اپي توپ هاي باكتري Ecoli O157:H7 باشد مي تواند در حيوان مدل ايجاد ايمني كرده و به عنوان كانديد واكسن مورد مطالعات بعدي قرار گيرد.

بررسي سنجش نيمه كمي بياني ژن نسبت به خود ژن به گونه اي كه بيان ژن با استفاده از يك جفت آغازگر يكسان نسبت به نمونه مجهول و نمونه استاندارد حاوي همان ژن (اما بصورت جهش يافته و با غلظت مشخص) انجام مي شود كه تكثير بيان همزمان اين دو نمونه به گونه اي انجام مي شود كه با پيشرفت واكنش غلظت محصولات هر دو نمونه يكسان مي شود و در اين مرحله با پيش آگاهي از غلظت نمونه استاندارد حاوي ژن جهش يافته مي توان غلظت نمونه هاي مجهول را تخمين زد. علاوه بر اين در روش پيشنهادي امكان آناليز همزمان چندين دوزاژژني (همانند روش Real - Time) PCR را فراهم مي كند. در واقع مهم ترين هدف در طراحي اين سيستم، امكان آناليز بياني يك ژن در طي چندين مراحل بياني مختلف مي باشد، كه اين امر به خصوص در درمان موثر سرطان كه نياز به تشخيص دقيق آن، بسيار حايز اهميت است.