لیست اختراعات با مالکیت
حسین عمرانی
1 عدد
در اين اختراع، بهترين سطح از فراواني آللي نشانگري براي انجام ارزيابي هاي ژنومي در صفت وزن بدن مورد بررسي قرار گرفت. در اين پژوهش از ركوردهاي 488 قطعه پرنده F2 حاصل از تلاقي متقابل جوجه هاي سريع الرشد آرين و جوجه هاي بومي كند رشد اروميه ايران در سنين 2 تا 7 هفتگي استفاده شد. نمونه خون تمام پرندگان براي استخراج DNA آنها با استفاده از روش Salting out، جمع آوري شد. نمونه ها با استفاده از تراشه Illumina 60K chicken Beadchip تعيين ژنوتيپ شدند. تعداد 48379 نشانگر SNP پس از عبور از مرحله كنترل كيفيت به پنج زيرگروه با فراواني آللي مختلف (MAF) (1/0-05/0، 2/0-1/0، 3/0-2/0، 4/0-3/0 و 5/0-4/0) تقسيم شدند. پس از اعتبارسنجي و مقايسه صحت ارزيابي دو روش BLUP و ssGBLUP با استفاده از متد 5-fold cross validation (CV)، ميانگين صحت پيش بيني ژنومي در روش ssGBLUP نسبت به روش BLUP براي هفته هاي 2، 3، 4، 5، 6 و 7 به ترتيب 03/59 %، 37/220 %، 46/0 %، 61/5 %، 45/0 % و 73/2 % بهبود داشت. همچنين، نسبت به اطلاعات صد درصد SNP ها، در هفته دوم براي هر يك از MAF هاي 1/0-05/0، 2/0-1/0 و 5/0-4/0 بهترتيب 6/0 %، 4/5 % و 6/0 %، در هفته سوم براي MAF 5/0-4/0 مقدار 66/16 %، در هفته چهارم براي هر يك از MAF هاي 4/0-3/0 و 5/0-4/0 بهترتيب 37/8 % و 05/6 %، در هفته پنجم براي هر يك از MAF هاي 4/0-3/0 و 5/0-4/0 بهترتيب 94/3 % و 5/4 %، در هفته ششم براي هر يك از MAF هاي 2/0-1/0 و 5/0-4/0 بهترتيب 31/7 % و 11/4 % و در هفته هفتم براي هر يك از MAF هاي 4/0-3/0 و 5/0-4/0 بهترتيب 54/7 % و 91/8 % بهبود ژنتيكي صحت پيش بيني حاصل شد. ضرايب رگرسيوني پيش بيني ژنومي حاصل از اطلاعات صد درصد SNP ها و اطلاعات مربوط به هر زيرگروه MAF قابل قبول بود. نتايج علاوه بر تائيد برتري ssGBLUP در مقايسه با BLUP، برتري زيرگروه ماركرهاي با MAF 5/0-4/0 نسبت به اطلاعات صد در صد SNP ها در بهبود صحت پيش بيني ژنومي در هفته هاي مختلف را نشان داد. استفاده از SNP هاي با فراواني آللي 5/0-4/0 در ارزيابي هاي ژنومي و همچنين ايجاد تراشه هاي كم تراكم نشانگري با فراواني آللي 5/0-4/0، علاوه بر تحميل هزينه ژنوتيپ پايين، ميتواند براي رتبهبندي مطمئن افراد بر اساس شايستگي ژنتيكي صفت وزن بدن مورد استفاده قرار گيرد. The process of genomic evaluation of growth trait in poultry using selective markers
موارد یافت شده: 1