يكي از مهمترين اصول هيستولوژي و بررسي بافت گياهي و جانوري با استفاده از ميكروسكوپ هاي نوري رنگ آميزي آن است كه منجر به ايجاد تمايز بين بخش هاي مختلف بافت، سلول و شناسايي آن مي گردد. تشخيص هسته و سيتوپلاسم سلولي به ترتيب با توجه به خاصيت اسيدوفيلي و بازوفيلي بارنگ هاي موجود، هماتوكسيلين به عنوان رنگي كه هسته سلول را رنگ مي كند و ائوزين به عنوان ماده رنگ كننده سيتوپلاسم از پركاربردترين رنگ ها هستند. اين رنگ ها به دليل وارداتي و گران قيمت بودن و پروسه ي طولاني تهيه رنگ، هزينه هاي گزافي در پي دارند. رنگ هاي گياهي بومي ايران به دليل در دسترس و ارزان بودن و پروسه ي آماده سازي كوتاه مي توانند جايگزين مناسبي براي اين رنگ هاي شيميايي باشند. عصاره پوست سبز گياه گردو(Juglans ) به عنوان جايگزيني براي رنگ ائوزين جهت رنگ آميزي سيتوپلاسم سلول و عصاره گل گياه ختمي (Althaea officinalis)به عنوان جايگزيني براي رنگ هماتوكسيلين جهت رنگ آميزي هسته سلول مي تواند در مراكز پاتولوژي، مطالعات بافت شناسي و مطالعات ميكروسكوپي مورد استفاده قرار گيرد.