يكي از روش هاي كارآمد در جداسازي و شناسايي اسيدهاي نوكلئيك (DNA) روش الكتروفورز يا جداسازي مولكول ها با حركت دادن ذرات معلق باردار در محيطي مناسب تحت اعمال ميدان الكتريكي است. در اين طرح، يك دستگاه ژل الكتروفورز نوع ميدان پالسي شرح داده مي شود كه در آن جهت و شكل ميدان الكتريكي از طريق كلمپ سطوح ولتاژ بر روي يك منحني بسته ايجاد مي شود. در واقع 24 الكترود ولتاژ بشكل خاصي بر روي محيط يك شش ضعلي منتظم در محفظه تانك الكتروفورز چيدمان مي شوند. سپس در مدت زمان پالس اوليه، يك جفت از مجموعه الكترودهاي موازي ( الكترودهاي درايو) فعال شده و در مقدارφ0 كلمپ مي شوند تا جهت اصلي ميدان الكتريكي را تعيين نمايند. ولتاژ ساير الكترودها در مقدار مياني كلمپ مي شود تا شكل ميدان الكتريكي ايجاد شده بوسيله الكترودهاي درايو را كنترل و يكنواخت نمايند. در زمان پالس بعدي، دسته دومي از الكترودها فعال شده به طوري كه دامنه ميدان الكتريكي جديد با ميدان قبلي برابر بوده و با آن زاويه 120 درجه مي سازد. اين مكانيزم در زمانهاي پالس بعدي مجددا تكرار مي شود. در اثر اعمال ميدان الكتريكي در جهت هاي مختلف، مولكولهاي پيچيده و طويل DNA از هم باز شده و وادار به حركت در جهت هاي مختلف مي شوند. نتيجه اين فرايند حركت مولكول ها به شكل زيگزاگ در ژل بوده كه به جداسازي آن ها مي انجامد. مولكول هاي بزرگتر به علت كندي حركت (نسبت به مولكول هاي كوچك تر) جباجايي كمتري در ژل داشته و با اعمال ميدان الكتريكي در زمان طولاني تر تفكيك كامل صورت مي پذيرد.