امروزه تصاوير رزونانس مغناطيسي MRI و پرتونگاري كامپيوتري CT به كمك پزشكان آمده و مكان بافت هاي آسيب ديده يا تومورها را براي آنان آشكار مي نمايد. و بدين ترتيب درمان را سريع تر كرده و خطرهاي حين عمل و پس از آن را كاهش مي دهد. در اين سيستم از تصاوير MRI و CT براي جراحي هاي مغز استفاده مي شود. اين تصاوير در نرم افزارهاي سيستم بارگذاري مي شوند. بخش هاي مورد نياز تصاوير به صورت سه بعدي در مي آيد، سپس حين عمل جراحي مسير ابزار جراحي را مي توان مشاهده كرد و هر لحظه فاصله نوك ابزار با مكان مورد نظر در مغز را كنترل كرد. در نرم افزار 3DUT Slicer امكانات گسترده و متنوعي قرار داده شده است كه با كمك آن مي توانيد تطابق مناسبي بين فضاي واقعي حين عمل جراحي و شكل سه بعدي از پيش به دست آمده مغز و اجزاي داخل آن ايجاد كرد. بدين صورت كه پيش از عمل جراحي تعداد زيادي تصوير از مغز گرفته مي شود، اين تصاوير به صورت دوبعدي در نرم افزار بارگذاري مي شود. با استفاده از نرم افزار 3DUT Slicer تصاوير تركيب شده و تصوير سه بعدي آن حاصل مي شود. اجزاي سيستم عبارتند از دوربين Localizer, IR، كامپيوتر گريد پزشكي و نرم افزارهاي سيستم. دوربين داراي سه CCD مي باشد كه گيرنده هاي IR بوده و مكان نقطه را در فضا تعيين مي كنند همچنين وسيله اي به نام Localizer همراه دوربين است كه با هم ارتباط برقرار مي كنند. روي Localizer چهار IRED يا ديود فرستنده پرتو IR وجود دارد كه توسط دوربين رديابي شده همچنين يك ديود گيرنده روي آن قرار دارد كه براي ايجاد ارتباط با دوربين روي آن تعبيه شده و به اين صورت، مكان آن در فضاي واقعي تعيين مي گردد. ابزار جراحي به نوك آن متصل مي شود. با كمك روابطي كه به شكل ابزار مربوط مي شود مي توان مختصات نوك ابزار را مشخص كرد. نرم افزار etKDemo براي ايجاد ارتباط بين Localizer و دوربين وجود دارد تا مقادير مختصات x,y.x نقطه سر ابزار جراحي به دوربين منتقل شده و از آنجا به نرم افزار 3DUT Slicer منتقل شود. همچنين فضاي واقعي توسط چهار نقطه غير هم سطح marker روي سر بيمار، به نرم افزار 3DUT Slicer معرفي شده و register مي شود. اين عمل توسط نرم افزار 3DMS Microcal انجام مي شود. بدين صورت فضاي واقعي سر بيمار كاملا در محيط سه بعدي نرم افزار شبيه سازي مي شود.