به طور معمول جهت بررسي پتانسيل باروري در بيماران نابارور از آزمايش اسپرموگرام جهت تعيين تعداد ، حركت و شكل اسپرم ها مورد استفاده قرار مي گيرد. ولي مطالعات جديد نشان مي دهد كه وضعيت كروماتين و پروتئين هاي مسوول در ايجاد تراكم در ساختار كروماتين نيز اهميت بسيار زيادي در پيشگويي پتانسيل باروري افراد دارد. به همين جهت تست هايي كه بتواند به صورت كلينيكي ميزان كمبود اين پروتئين ها و در نهايت وضعيت كروماتين اسپرم را مورد بررسي قرار دهد، بسيار با اهميت است. روشهاي متفاوتي جهت بررسي ميزان كمبود پروتامين (پروتئين اصلي جهت متراكم نمودن ساختار كروماتين اسپرم) مورد استفاده قرار مي گيرد كه اكثر آنها نياز به ابزارها و مواد گران قيمت، نياز به زمان زياد و همچنين نياز به پرسنل مجرب دارد. اساس عملكرد اين تست بدين صورت مي باشد ساختار كروماتين اسپرم انسان در مقايسه با سلولهاي ديگر بدن بسيار فشرده و متراكم است. مولكول پروتامين مسوول ايجاد اين فشردگي زياد در ساختار كروماتين اسپرم مي باشد. مطالعات نشان داده است كه هر گونه نقص و كمبود در ميزان پروتامين، باعث عدم فشردگي صحيح در كروماتين شده و در نهايت مي تواند يكي از عوامل ناباروري در مردان گردد. با بررسي ميزان كمبود پروتامين مي توان به طور غير مستقيم وضعيت تراكم ساختار كروماتين هسته اسپرم را پيش بيني كرده و از آن به عنوان يك فاكترو مهم جهت پيشگويي پتانسيل باروري در مردان استفاده نمود. جهت اين منظور مي توان از رنگ فلورسنت كرومومايسين (CMA3(A3 استفاده نمود. اين رنگ به شيار بزرگ DNA اتصال پيدا كرده و پس از اتصال از خود رنگ فلورسنت ساطع مي كند. اين رنگ در مكان هايي اتصال پيدا مي كند كه پروتامين در آن حضور نداشته باشد. بنابراين ميزان نور فلورسنت ساطع شده بيانگر ميزان كمبود پروتامين در ساختار اسپرم مي باشد. كاربرد اصلي اين تست به صورت كلينيكي در آزمايشگاه هاي تشخيص ناباروري و آندرولوژي مي باشد.

كروماتين اسپرم نيمي از ژنوم نسل آينده را با خود حمل مي كند، بنابراين سلامت و يكپارچگي آن از اهميت بسزايي برخوردار است. نتايج مطالعات نشان مي دهد كه در افرادي كه داراي آسيب DNA بالايي هستند، كيفيت پارامترهاي اسپرمي و قدرت باروري كاهش مي يابد. با توجه به اهميت اين مسئله، اخيرا محققان بر ضرورت ارزيابي ميزان آسيب DNA اسپرم بعنوان يك تست تكميلي، علاوه بر بررسي پارامترهاي اسپرمي در آزمايشگاه ها تاكيد كرده اند. تست SCSA‌ (Sperm Chromatin Structure Assay)، به عنوان يك تست قابل اعتماد كلينيكي جهت ارزيابي آسيب DNA اسپرم مي باشد. اساس اين تست ارزيابي وضعيت DNA اسپرم از طريق اندازه گيري حساسيت DNA نسبت به دناتوره شدن تحت تيمارهاي خاص مانند اسيد است. اين اظهارنامه ارائه كيت بررسي آسيب DNA به روش SCSA مي باشد كه حاوي 4 محلول است. از بافر TNE براي رقيق كردن نمونه اسپرمي استفاده مي گردد. سپس نمونه تحت تيمار با اسيد دترجنت و رنگ آكريدين اورنج حل شده در محلول استينينگ كه در نقشه ارائه شده است، قرار گرفته، سپس با دستگاه فلوسايتومتري بررسي مي گردد. در صورتيكه رنگ آكريدين اورنج به DNA دست نخورده در اسپرم‌هاي سالم متصل شود، نور فلورسنت سبز و در شرايطي كه اين رنگ به DNA تك رشته‌اي متصل شود، نور فلورسنت قرمز، ساطع مي شود. اين كيت، هم در سطح كلينيكي و هم در تحقيقات كاربرد دارد.