لیست اختراعات سعید ملک قاسمی
كنترل استاندارد وزن مولكولي DNA، به طور معمول همراه با نمونههايDNA ، در آزمايشگاههاي زيست شناسي مولكولي بر روي ژل قرار ميگيرد و الكتروفورز ميشود تا به عنوان مرجع وزن مولكولي DNA عمل كند. هضم آنزيمي DNA ژنومي، پلاسميد و تكثير با روش PCR از جمله اصليترين گزينهها براي توليد انواع ماركرهاي تجاري مختلف محسوب ميشوند، كه هر كدام داراي معايب بسياري هستند. در اين اختراع ما يك روش جديدي براي ساخت پلاسميد توليد كننده ماركر DNA معرفي نمودهايم، كه شامل تكثير قطعات DNA داراي تواليهاي همپوشان توسط PCR و اتصال اين قطعات به يكديگر براي ايجاد وكتور نوتركيب است. در اين روش، براي ساخت قطعات با وزنهاي متفاوت از پرايمرهاي داراي جايگاه آنزيمهايEcoR1 و Bbs1 استفاده شد كه بعد از تيمار توسط آنزيمBbs1 و ساخت وكتور نوتركيب، تنها با يك واكنش برش توسط آنزيم EcoR1 ماركر DNA ايجاد ميشود. به منظور يكسان سازي غلظتهاي هر يك از باندها تعداد متفاوتي از هر يك از قطعات درون وكتور قرار داده شد. از اين نشانگر وزن مولكولي DNA، ميتوان براي اندازگيري دقيق سايز باندهايDNA ، با طول 100 تا 3000 جفت باز، كه يك محدودهي مناسب براي بسياري از قطعات در طول الكتروفورز است، استفاده كرد. كنترل استاندارد وزن مولكولي DNA، به طور معمول همراه با نمونههايDNA ، در آزمايشگاههاي زيست شناسي مولكولي بر روي ژل قرار ميگيرد و الكتروفورز ميشود تا به عنوان مرجع وزن مولكولي DNA عمل كند. هضم آنزيمي DNA ژنومي، پلاسميد و تكثير با روش PCR از جمله اصليترين گزينهها براي توليد انواع ماركرهاي تجاري مختلف محسوب ميشوند، كه هر كدام داراي معايب بسياري هستند. در اين اختراع ما يك روش جديدي براي ساخت پلاسميد توليد كننده ماركر DNA معرفي نمودهايم، كه شامل تكثير قطعات DNA داراي تواليهاي همپوشان توسط PCR و اتصال اين قطعات به يكديگر براي ايجاد وكتور نوتركيب است. در اين روش، براي ساخت قطعات با وزنهاي متفاوت از پرايمرهاي داراي جايگاه آنزيمهايEcoR1 و Bbs1 استفاده شد كه بعد از تيمار توسط آنزيمBbs1 و ساخت وكتور نوتركيب، تنها با يك واكنش برش توسط آنزيم EcoR1 ماركر DNA ايجاد ميشود. به منظور يكسان سازي غلظتهاي هر يك از باندها تعداد متفاوتي از هر يك از قطعات درون وكتور قرار داده شد. از اين نشانگر وزن مولكولي DNA، ميتوان براي اندازگيري دقيق سايز Making plasmid producing DNA marker
تشخيص RNA نقش مهمي در زمينههاي مختلفي از جمله پزشكي، كشاورزي و زيستفناوري دارد. روشهاي سنتي تشخيص RNA مانند PCR و Northern blot محدوديتهايي از جمله زمانبر بودن و عدم اختصاصيت دارند. با توجه به نياز به يك روش سريع، ساده و اختصاصي براي تشخيص RNA ، يك حسگر RNA كه از سيستم ويرايش ژن CRISPR-Cas9 و مكانيسم جابجايي رشتهها براي تشخيص RNAهاي خاص استفاده ميكند، ارائه شده است. اين حسگر ميتواند در آزمايشگاه (In-vitro) و داخل سلول (In-cyto) براي كاربردهاي مختلفي از جمله تشخيص بيماري، بررسي بيان ژن و ويرايش ژنوم استفاده شود. اين پلتفرم، بر اساس دو مولفه اصلي، سيستم ويرايش ژن CRISPR-Cas9 و مكانيسم جابجايي رشتهها با استفاده از دو جايگاه Toe-Hold، عمل ميكند. واكنش اين حسگر با يك رشته RNA راه انداز (Trigger RNA) ، باعث فعال شدن سيستم CRISPR-Cas9 ميشود. اين فرايند خود منجر به برش DNA هدف ميشود كه در سطح آزمايشگاهي قابل مشاهده بر روي ژل آگارز است. باتوجه به اختصاصيت آن، ميتواند براي تشخيص زودهنگام بيماري، پايش و تشخيص عفونت هاي ويروسي كاربرد داشته باشد. اين پلتفرم يك روش نوآورانه براي تشخيص RNA ارائه ميدهد كه با ادامه توسعه، در آينده به ابزاري ارزشمند براي تشخيص، درمان و تحقيقات تبديل شود.
موارد یافت شده: 2