در حال حاضر آنتي¬بادي¬هاي درماني به ¬همراه قطعات آنتي¬بادي Fab (antibody fragment) بخش عظيمي (حدود P) از بازار داروهاي پروتئيني را به خود اختصاص داده است و سريع¬ترين رشد را در صنايع دارويي نشان مي¬دهد. قبل از تكنولوژي DNA نوتركيب Fab از طريق سيستئين پروتئاز پاپائين ايجاد مي¬شد كه يك روش غير اختصاصي بود. در حال حاضر Fab بيشتر توسط تكنولوژي DNA نوتركيب توليد مي¬شود و چون گليكوزيله نيست بيان آن در E. coli نسبت به بيان IgG در سلول پستانداران اقتصادي¬تر است. حدود 0 داروهاي نوتركيب كه توسط وزارت غذا و داروي آمريكا و اروپا پذيرفته شده¬اند در E. coli توليد مي¬شود. البته بيان پروتئين در اين ميكروارگانيسم محدوديت¬هايي نيز دارد كه مهم¬ترين آن¬ها عدم تشكيل صحيح ساختار پروتئين به دليل ايجاد اجسام انكلوزيون نامحلول است. از بهترين راهكارها براي غلبه بر اين مشكل بيان پروتئين به¬صورت فيوژن است. SUMO Tag يكي از فيوژن¬هايي است كه علاوه بر مزاياي استفاده از اين تكنولوژي، به علت وجود پروتئاز اختصاصي كه ساختار سه بعدي آن را شناسايي مي¬كند، فاقد مشكل برش در پروتئين نوتركيب است. ليكن تاكنون به صورت دوگانه (dual SUMO) در بيان Fab fragment مورد ارزيابي قرار نگرفته است.در اين مطالعه به منظور بررسي افزايش بيان و محلوليت Fab در E. coli از anti-VEGF-A به عنوان مدل استفاده مي¬شود. اثرات فيوژن پروتئين SUMO در بيان سيتوپلاسمي Fab با طراحي وكتور Dual SUMO‌ براي اولين بار بررسي خواهد شد.

BMP ها پروتئين هايي با خاصيت تحريك استخوان زايي هستند كه براي درمان شكستگي هاي حاد بكار مي روند. عليرغم مزاياي زياد، تجويز دوز بالايي از اين پروتئين هاي نوتركيب براي بدست آمدن نتايج كلينيكي مطلوب لازم است كه اين مسئله به نوبه خود باعث بروز عوارض جانبي و هزينه هاي سنگين درمان مي شود. استراتژيهاي متفاوتي براي توليد نسل دوم BMP ها با كارايي بيشتر و عوارض جانبي كمتر بكار برده شده اند، مثلا دستكاري ژنتيكي و تغيير ناحيه اتصال به هپارين، به منظور افزايش زمان ابقاء (local retention time) مورفوژن در محل اثر، يكي از اين روش ها محسوب مي شود. به منظور بهبود خواص BMP-7، موتانت جديدي از اين پروتئين با موفقيت در ميزبان يوكاريوتي (CHO) بيان گرديد. جايگزيني پايانه آميني BMP-7 با ناحيه اتصال به هپارين از BMP-2، به منظور افزايش ظرفيت اتصال به تركيبات ماتريكس خارج سلولي از جمله هپارين و هپاران سولفات صورت گرفت. موتانت جديد علاوه بر داشتن فعاليت بيولوژيكي، قابليت اتصال به هپارين بيشتري نسبت به نوع تجاري از خود نشان داد. به نظر مي رسد اين پروتئين با ناحيه اتصال به هپارين تقويت شده به عنوان اولين داروي نسل دوم مزيت هاي كلينيكي بيشتري نسبت به فرم تجاري موجود ارائه دهد .

‏خلاصه ‏عنوان : فرايند سنتز و روش عمل تركيبات جديد با خاصيت مهاركنندگي توليد اسيدآمينه هاي آليفاتيك (شاخه دار)در سيستم قارچي با استفاده از روش سنجش معكوس ( reversal Assay ‏) تعداد رو به افزايش قارچ هاي مقاوم به دارو اهميت جستجو براي داروهاي ضد قارچي را مورد تاكيد قرار مي دهد. اگرچه غربال گنجينه هاي شيميايي و يا طبيعي يك راه اصلي يافتن تركيبات ضد قارچي ‏ولي همچنان مكانيسم اثر تركيبات مورد توجه صنايع داروسازي مي باشد ‏يكي از روش هاي شناسايي مكانيزم عمل، (سنجس معكوس) است كه پايه آن بر توانايي واسطه هاي متابوليكي يا محصول نهايي مسير مسدود شده توسط داروي موردنظر در بي اثر نمودن دارو قرار دارد. در اين مطالعه تركيب ضدقارچ سنتزي كه از لحاظ ساختاري مشابه داروهاي ضدقاچ كنوني نمي باشند، به كارگرفته شده است . بر اساس يافته ها. تركيبات سنتتيك ما اسيدآمينه هاي آليفاتيك را مهارمي كند. با توجه به اينكه اين تركيب مسير سنتز اسيدآمينه هاي شاخه دار را هدف قرار داده است ، سطح بيان ژن هاي دخيل در ساخت اين اسيدهاي آمينه با استفاده از تكنيك ‏ RT-PCR مورد بررسي قرار گرفت. با استفاده از RT-PCR نيمه كمي بر روي نمونه هاي RNA استخراج شده از مخمر ساكارومايسس سرويزيه در دو حالت حضور و عدم حضور ماده ضد قارچي ميزان بيان ژنهاي كانديد مورد آناليز قرار گرفت. نتايج نشان داده است كه سطح بيان ژن ILV5 كه كد كننده يك آنزيم كليدي در مسير سنتز اسيدهاي آمينه مذكور مي باشد، در حضورماده ضد قارچي تغيير نموده است كه اين امر نشان دهندهَ فعاليت اين تركيب سنتزي در مهار مسير سنتز اين اسيدهاي آَمينه مي باشد. در نهايت برهمكنش تركيب سنتزي ضد قارچي و آنزيم ILV5(Acetohydroxyacid reductoisomerase) توسط نرم افزار ArgusLab در حالت مختلف بررسي شد. انرژي آزاد Ebinding)) بهينه ترين حالت برهمنكش تركيب سنتزي ضد قارچي و آنزيم ILV5 تعيين گرديد كه مي توان نتيجه گرفت در in silico تمايل تركيب سنتزي ضد قارچي و آنزيم ILV5 نسبتا بالا مي باشد.

اختلال در مسير پيام‌رساني فاكتور رشد هپاتوسيت/ فاكتور تبديل مزانشيمي-اپيتليالي (HGF/c-Met در انواع بدخيمي‌ها و ارتباط آن با تهاجم تومور و پيش آگهي ضعيف، c-Met را به عنوان يك هدف درماني مهم مطرح نموده است. اگرچه مطالعات متعدد منجر به توليد چندين آنتي بادي مونوكلونال و مهاركننده‌هاي مولكول كوچك عليه c-Met شده است، اما تا بحال، هيچ يك از اين مولكول‌هاي درماني براي استفاده در بالين مورد تأييد قرار نگرفته‌اند. در مطالعه حاضر با هدف جداسازي آنتي‌بادي‌هاي كاملاً انساني عليه آنتي ژن c-Met، يك كتابخانه غيرايمن بزرگ از قطعه متصل شونده به آنتي‌ژن (Fab) با اندازه عملكردي 1010× 5/5 كلون، با استفاده از روش نمايش فاژي توليد شد. كتابخانه به دست آمده با هدف جداسازي قطعات Fab اختصاصي آنتي ژن c-Met، متحمل پنج دور پياپي پنينگ در برابر دومين خارج سلولي آنتي ژن نوتركيب c-Met، شد. پس از غربالگري كلون‌ها با استفاده از روش الايزاي منوكلونال، چهار كلون با بيشترين تفاوت OD450 نسبت به گروه‌هاي كنترل، انتخاب و پس از تاييد بيان قطعات Fab با استفاده ازwestern blot ، تعيين توالي شدند. توانايي آنتي‌بادي‌هاي انتخاب شده براي اتصال به آنتي‌ژن‌هاي native در سطح سلول‌هاي MKN45 بيان كننده آنتي‌ژنc-Met (يك رده سلولي متاستازي آدنوكارسينوم معده انسان) با استفاده از فلوسيتومتري مورد ارزيابي قرار گرفت. از بين 4 كلون تأييد شده از نظر بيان قطعه Fab و قابليت اتصال به آنتي‌ژنc-Met در الايزاي منوكلونال، كلون C16، با افينيتي 109 M-1 ×0.3 ، بالاترين (63%) ميزان اتصال به سلول‌هاي MKN45 را نسبت به رده سلولي كنترل منفي T47D (رده سلولي سرطان سينه با عدم بيان c-Met) (9.03%) نشان داد. در نهايت مطالعه ما يك كتابخانه آنتي بادي غيرايمن، به عنوان يك منبع با‌ارزش براي يافتن آنتي‌بادي‌هاي اختصاصي جديد Fab عليه طيف وسيعي از آنتي‌ژن‌ها فراهم نموده، همچنين، با معرفي يك آنتي بادي Fab كاملاً انساني با افينيتي بالا و اختصاصي آنتي‌ژن c-Met، (C16)، كه داراي پتانسيل تبديل به آنتي‌بادي درماني، يا استفاده به عنوان عامل انتقال مواد شيمي درماني مي‌باشد، راهبردي براي از بين بردن سلول هاي توموري c-Met مثبت ارائه مي‌دهد.